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重慶海關技術中心（以下簡稱技術中心）是中編辦批復成立的公益二類事業單位。其職能是承擔重慶海關關區進出境的實驗室檢測、隔離檢疫、化驗鑒定、研究咨詢與風險分析；承擔科技與技術開發、服務，提供技術指導，開展有關海關技術法規、標準的制修訂；按照有關規定提供委托檢驗、檢測、校準、鑒定、認證、檢疫處理、培訓、咨詢、開發與轉讓等服務。技術中心是中國合格評定認可委員會（CNAS）首批認證認可機構，取得國家食品檢驗（復檢）機構、國家進出口商品檢驗鑒定機構、國家農產品質量安全檢測機構、生物安全二級實驗室、全國土壤污染狀況詳查實驗室、全國無公害農產品定點檢測機構、重慶市社會環境檢測機構、重慶市檢查機關環境損害公益訴訟鑒定和監測機構等資質。技術中心現有有機農產品、中藥材、牛病、電子電器、危險化學品5大國家級重點實驗室，重慶市食品安全和進境陸生動物2大工程中心。同時結合重慶市分析測試學會環境與產品質量檢測專委會、重慶市大型科學儀器資源共享服務中心分中心、重慶市博士后科研工作站、德國萊茵TUV合作實驗室、重慶市進出境動植物檢疫及物種資源保護體驗中心（重慶市和原質檢總局雙認定的科普基地）以及重慶跨境電子商務安全風險監測管理綜合服務平臺等工作平臺，重慶市食品安全和進境陸生動物2大工程中心，積極打造海關執法技術支撐、科技創新及技術研發、公益檢測及技術服務平臺。技術中心檢測能力涉及食品、農產品、動植物及其產品、化工品、礦產品、飼料、化肥、化妝品、日化用品、紡織服裝、玩具、電池、電子電器產品、土壤及沉積物、水、固體廢物等的物理、化學、微生物、物疫病、有害生物鑒定、化學品安全評估項目。具備的校準能力有天平砝碼、玻璃量具、壓力表等。技術中心實驗室共有52個大類、9443個項目通過認可和資質認定。技術中心現有人員涉及生物、獸醫、藥物化學、微生物工程、植物檢疫、環境科學、分析化學、紡織工程、食品工程、轉基因工程、電子電器檢測、法律等多個學科和專業，已形成了一支專業門類齊全、技術精良，人員年齡及層次結構合理、綜合素質高的實驗室人才隊伍。